SERVICIOS BIOINFORMATICA



SERVICIOS DISPONIBLES

Diseño de base de datos y RedCap


Diseño de base de datos y RedCap

  • Diseño de los protocolos y cuadernos electrónicos de recogida de datos electrónicos (CRF)
  • Auditoria de base de datos y sistema de gestión de información: refactorización, depuración, estandarización
  • Gestión y asesoramiento de la plataforma de gestión de datos REDCap integrada en el sistema sanitario Andaluz
Bioinformatica


Bioestadistica

  • Diseño de scripts y automatización de procesos.
  • Asesoramiento especializado sobre herramientas bioinformáticas destinadas a la investigación
  • Automatización de procesamiento de datos y análisis estadísticos
omicas


Estudios Omicos

  • Estudios de genómica comparativa (búsqueda de genes/clusters/funciones diferenciales, comparación entre cepas, identificación de variantes, etc.)
  • Identificación y anotación funcional de genes
  • Estudios metabólomica, proteómica, microbiota
mixomics


Integraccion multiomica

  • Integración multivariante multiómica (Mixomics)
  • Integración funcional
epigenomica


Epigenómica

  • Análisis de datos de Methylation-450K BeadChip y MethylationEPIC 850K
  • Identificación y estudio de regiones reguladoras de la transcripción
  • Identificación y comparación de patrones de metilación
aplicaciones


Aplicaciones

  • Diseño de herramientas y programas especializados para la investigación biomédica
  • Conversión de programas y herramientas de investigación a diferentes lenguajes
metodologia


Asesoramiento metodológico

  • Revisión y asesoramiento de proyectos de investigación
  • Intermediación y asesoramiento a los grupos de investigación para la generación de proyectos transversales
  • Búsqueda de potenciales colaboraciones
análisis-funcionales-de-genes-proteínas


Herramientas en desarrollo

  • Herramienta de análisis de interacción entre parámetros de diferente naturaleza en patologías complejas
  • Herramienta de análisis de sucesión de eventos patológicos
análisis-funcionales-de-genes-proteínas


Cohort Analyzer

  • Herramienta para la evaluación de la calidad fenotípica de cohortes de pacientes y enfermedades
  • Emplea datos de pacientes o enfermedades caracterizadas en términos fenotípicos de la Human Phenotype Ontology (HPO) y devuelve un informe con tablas y gráficos sencillos de interpretar
  • También lleva a cabo un agrupamiento de los pacientes o enfermedades en base a la similitud semántica de sus perfiles de HPO. Esto sirve como apoyo para mejorar la caracterización fenotípica y asociar con mayor precisión fenotipos a genes
análisis-funcionales-de-genes-proteínas


Priorización de variantes a partir de información fenotípica

  • Flujo de trabajo que incluye distintas herramientas para la priorización de variantes genéticas basadas en el análisis de los fenotipos HPO de los pacientes
  • Las herramientas (Exomiser, LIRICAL y Phen2Gene) se basan en el análisis de datos fenotípicos de los pacientes para llevar a cabo la priorización de la información exómica
  • Se puede configurar el flujo de trabajo para trabajar de forma personalizada con uno o varios de los algoritmos de priorización mencionados


OBJETIVOS

    • Asesorar en el uso de recursos informáticos, desde la etapa de diseño hasta el análisis de los resultados, incluyendo el diseño de la metodología.
    • Intermediar entre grupos con enfoque clínico y grupos con enfoque bioinformático para la realización de proyectos transversales.
    • Asesorar en el diseño de proyectos de investigación especialmente los aspectos relacionados con el procesamiento de la información y los análisis informáticos.
    • Impartir cursos de formación y seminarios de divulgación en bioinformática.
    • Desarrollar aplicaciones y herramientas específicas para resolver problemas concretos planteados por los investigadores.
    • Dar apoyo a la creación de planes de gestión de datos (PGD) de Investigación Biomédica.

DOCUMENTOS


    SOLICITUD DE SERVICIOS

    Para solicitar un servicio,  por favor póngase en contacto con Andrés escribiendo a la siguiente dirección de correo electrónico indicando el tipo de servicio:

    Servicios Carácter Informático       bioinformatica@ibima.eu

    La unidad le enviará un email para confirmar su recepción e iniciar el procedimiento  del servicio solicitado

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    Calle Severo Ochoa, 35
    Parque Tecnolgico de Andaluca (PTA) Campanillas, Mlaga 29590

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